As emissões de gases e partículas em queimadas na Amazônia (e também no Estado de São Paulo) tem forte impacto sobre o funcionamento do ecossistema e sobre a saúde da população. As partículas de aerossóis emitidas aumentam as taxas de mortalidade de modo significativo sobre largas regiões da Amazônia e do cerrado brasileiro. As emissões também alteram o balanço radiativo atmosférico e os mecanismos de formação e desenvolvimento de nuvens. O ozônio produzido a partir de emissões de compostos de nitrogênio e hidrocarbonetos afeta a produtividade agrícola e também tem efeitos na saúde da população. Fenômenos similares ocorrem em queimadas de cana de açúcar no estado de São Paulo.